高宗咸亨四年，高宗患病，詔孫祖入宮，蒙高宗看重。上元元年，孫祖打算訂補《千金要方》，藉口患疾，請允還山。高宗感其忠誠侍御十六年，特賜良馬和原鄱陽公主封邑，後來，孫祖回到華原五台山。於開耀元年，撰成三十卷《千金翼方》。是年冬天，孫祖無疾而終，享年141歲。孫祖遺囑弟子對其薄葬，不藏明器，不奠牲牢。停屍月余，顏貌如生，色潤不改。入殮就棺時，發現衣裳空空，人們感到很奇怪，都認為是屍解成仙了。孫祖傳世著作達七十七種，加上一些節本總八十六種。其中最著名的《千金要方》《千金翼方》被後世奉為醫學聖典。
唐高宗咸亨二年，《千金要方》流傳到日本，視為國寶。宋英宗治平三年，林億奉詔修《千金要方》，刊布於世。宋徽宗宣和四年，郭思刪節《千金要方》為《千金寶要方》，刻石於華州官署。明代宗景泰六年，楊勝賢木刻本傳世。明穆宗隆慶六年，刻《千金寶方》、《海土方》石碑於五台山。唐末，時人稱五台山為「藥王山」，並建「藥王祠」。
宋徽宗封孫祖為「妙應真人」，明世宗定他為「先臣」，清順治奉他為「神醫」。此後，「藥王孫祖」家喻戶曉人人皆知。
潛心醫藥治病救人
淡泊名利得道升仙
據史書記載，孫思邈從小勤奮好學，七歲讀書，每日能背誦一千多字，有「神童」之稱。二十歲已精通諸子百家學說，融匯三教，尤其擅長天文、曆法、占卜等術。
關於孫思邈的學醫經歷，據《千金藥方》自序所說：「其自小體弱多病，又看到周圍百姓為病折磨而死的慘狀，遂萌生了精研醫道的決心。
孫思邈一生刻苦鑽研，他將唐以前所流傳下來的各種藥方及自己行醫的驗方，同時又廣泛收集民間的各種藥方及經驗，遂著成了聞名於世的醫學寶典《千金要方》。
孫思邈所著的《千金要方》三十卷，內容極為豐富，分醫學總論，婦人、少小嬰孺、七竅、諸風、腳氣、傷寒、內臟、癰疽、解毒、備急諸方、食治、平脈、針灸等，共計二百三十二門，收方五千三百例。其中，該書還首創「復方」的先例，如《傷寒論》的體例是一病一方，而他在《千金要方》中發展為一病多方，還靈活變通了張仲景的「經方」。他有時兩三個經方合成一個「復方」，以增加治療效果；有時一個經方分成幾個單方，以分別治療某種疾病。這是他對醫學的重大建樹，也是醫學史上的重大革新。
《千金翼方》是孫思邈對《千金要方》的補編書。此書共三十卷，其中他將唐代以前本草書中沒有記載的810餘種藥物，進行考證和實踐，並補充了很多方劑和治療方法。《千金翼方》和《千金要方》兩部書，合稱為《千金方》。《千金方》是唐以前醫藥成就最全面、最有價值的系統總結，它是我國現存最早的醫學類書。
《歷代名醫圖贊》說：「唐孫真人（真人，即對高道的稱謂），方藥絕倫，扶危拯溺，應效如神」。宋代郭思高度評價《千金方》時說：「世皆知此書為醫經之寶」。清代醫學家徐大椿說：「用意之奇，用藥之妙，亦自成一家」。
隨著盛唐文化的對外交流，《千金方》也隨之走向國外，深深影響了諸如日本、韓國、朝鮮的漢醫文化。
孫思邈在煉丹活動方面，他總結了唐以前的煉丹方式、方法、用藥及配方等，最後提出了「硫磺伏火法」的論述和方法。對我國「火藥」的發明做出了巨大貢獻！
孫祖是古今醫德醫術堪稱一流的名家，尤其對醫德的強調，為後世的習醫、業醫者傳為佳話。他的名著《千金方》中，也把「大醫精誠」的醫德規範放在了極其重要的位置上來專門立題，重點討論。而他本人，也是以德養性、以德養身、德藝雙馨的代表人物之一，成為歷代醫家和百姓尊崇備至的偉大醫學人物。
唐代名醫孫祖被尊為藥王，他卻不用動物入藥。他說：「自古名賢治病，多用生命以濟危急，雖曰賤畜貴人，至於愛命人畜一也。損彼益己，物情同患，況於人呼！夫殺生求生，去生更遠。吾今此方所以不用生命為藥者，良由此也。」（《備急千金要方》）
隋文帝輔政時期，欲聘其為國子博士，遭其婉拒，並說：「五十年後，自會有聖人出世，那時我自然會去助他，以濟生人」。唐太宗時，下旨召請思邈入京。但當太宗皇帝見到其真人時，不禁驚訝其容貌仿若少壯一般，感嘆道：「我素來聽說道長之德行，對您十分尊重，真羨慕那些能在您門下從學的徒眾，這是我的真心話」。遂欲授以爵位，思邈固辭不受。唐高宗初即位時，欲拜其為諫議大夫，思邈復固辭之。
唐高宗永徽三年二月十五日，時年已百有餘歲的孫思邈，於清晨沐浴後，儼其衣冠，端拱以坐。叫來堂下子孫說：「我為世人所逼，隱於洞府修煉，將升無何有之鄉，臣於金闕，不能應召往來。」並留遺囑，喪事從簡，語罷便氣絕身死。後人守喪一月有餘，見其容顏絲毫不變，猶如在世一般。剛欲舉屍入棺，卻只有一件空衣在此。在場的人這才省覺，其早已煉就屍解上道，位證真仙了。
藥王孫思邈真人傳說故事
1、志學於醫，槐蔭苦讀
孫思邈從小體弱多病。他先後兩次患熱病，一次患冷痢。每當他面黃肌瘦，飽嘗病痛之苦的時候，母親總是日夜守護在他的身邊，給他熬藥喂藥。父親也背著他翻溝過嶺去找醫生。次數多了，支付不起醫藥費用，就只好變賣家產。孫思邈看到，由於自己的病，給父母造成這麼大的困難，心裡難過。他從自己幼年的痛苦經歷認識到疾病對人的危害，體會到醫生能夠解除病人的痛苦。於是從很早就萌發了學醫的願望。